Александр Косьмич Флегинский родился 19 февраля (3 марта по н.с.) 1861 года в семье священника. По окончании Ставропольской духовной семинарии получил место псаломщика при Казанском соборе города Ставрополя. В этом же году рукоположен во диакона, а затем во священника и определен в клир храма мученика Лонгина сотника станицы Ключевой Кубанской области. В 1885 году переведен в станицу Красногорскую, где занимал должность окружного миссионера, а затем окружного духовника в благочинии. Был членом Ставропольского епархиального церковно-археологического общества.
В 1908 году переведен в станицу Георгие-Афипскую и назначен благочинным 17 округа. В марте 1918 года, в период установления советской власти, был схвачен большевиками. После жестоких истязаний и глумлений его вывезли за станицу и убили. Тело отца Александра было найдено только спустя много месяцев.
Это единственный кубанский святой, чьи святые мощи были обретены в новейшей истории. Это произошло 19 сентября 2017 года на Всесвятском кладбище Краснодара. Ныне мощи святого покоятся в Екатерининском кафедральном соборе Краснодара.
Долгое время не было известно, как выглядел святой. Недавно комиссия по канонизации святых нашла его исторический портрет. Основываясь на этой находке, краснодарский иконописец Владимир Бутов написал икону священномученика Александра Флегинского.
