Протоиерей Анатолий Шаргин родился 21 января 1960 года в селе Вагай, Тюменской области.
Проходил службу в армии и имел светскую специальность радиотелеграфиста.
Обучался в Московской духовной семинарии.
29 декабря 1989 года архиепископом Саратовским Пименом был рукоположен в диаконский сан, 19 апреля 1990 года – в иерейский.
17 ноября 2003 года отец Анатолий был принят в клир Екатеринодарской и Кубанской епархии и назначен настоятелем храма великомученика Георгия Победоносца г. Хадыженска, где прослужил до последнего дня своей жизни.
Отец Анатолий любил детей и всегда стремился приходить к ним с проповедью о Христе. Духовно окормлял две школы .
Помимо своего основного послушания протоиерей Анатолий Шаргин в разное время по совместительству был настоятелем Успенского храма станицы Куринской, Михайло-Архангельского храма станицы Кабардинской, окормлял храм святой великомученицы Анастасии Узорешительницы при исправительной колонии № 9 города Хадыженска.